A teljes fény-spektrumból a legerőteljesebb gyógyító hatása a vörös (pl. 660 nm) és az infravörös (pl. 808 nm) fénynek van. Az, hogy a lézersugár milyen mélyen képes behatolni a sejtekbe és hol fejti ki a hatást, szintén a hullámhossz függvénye.

A szoftlézeres kezelések során alkalmazott lézerek többnyire tehát vörös, infravörös hullámhosszon sugároznak. A lézerfény eléri a sejt mélyén lévő mitokondriumot, elnyelődik a citokróm-C-oxidázban és aktiválja azt, ennek eredményeképpen optimalizálja a sejtek oxigénellátását, így a mitokondrium képes több ATP (adenozin-trifoszfát) előállítására. Az ATP az egyetlen és legfontosabb formája az energiának, mely működtet minden kémiai reakciót a szervezet minden sejtjében.

Sérülés, gyulladás hatására a megbetegedett területen a sejtek élettani folyamatai lelassulnak vagy leállnak. Leáll a sejtszintű energiatermelés és fehérjeszintézis is, pedig a test öngyógyító folyamatainak fokozott energiaellátásra lenne szüksége a gyógyuláshoz. A lágylézer kezelés során kívülről juttatunk be energiát a szövetekbe, amely aktivál bizonyos enzimeket. Ez újraindítja a sejt számára energiát biztosító ATP molekulák termelését. A sejt működése felgyorsul az öngyógyító folyamatok megindulnak. A lézersugár elnyelődése során hő szabadul fel, mely felmelegíti a kezelt szöveteket. Ennek hatására a vérkeringés meggyorsul, elindul a bomlástermékek, gyulladásos méreganyagok eltakarítása és a gyógyító tápanyagok odaszállítása. A véráramlás fokozódása egyben hatékonyabbá teszi a nyirokelvezetést, így csökken a duzzanat és feszülés is.